故事描述在美丽的澳洲大堡礁海域中，活泼好动的小丑鱼尼莫，不幸被专门收藏观赏用鱼的潜水人士捉到，被卖入悉尼一间牙科诊所中，成为鱼缸中众多观赏鱼的一分子。尼莫开始必须面对一群陌生又怪异的新朋友，还得担心如何能与父亲老爸团聚；而另一方面，心急如焚的老爸决心要远度重洋试图找到尼莫，沿路上还遇见了热心助人，但只有短暂记忆的帝王鱼多莉。他们不畏艰险踏上了营救尼莫的惊险旅程；而老爸是否能顺利的营救尼莫，父子重新团圆呢？

　　这是一部制作精美，色彩艳丽，场面宏大，故事感人的电脑动画巨片。片中电脑制作的角色和景物异常逼真。而全片的故事更是充满了悬念，历险，亲情，友谊等诸多元素，对各个年龄层次的观众都有巨大的吸引力，可以说是迪士尼和皮克斯动画有史以来最成功的电脑动画影片。

　　《海底总动员》的导演是《虫虫特工队》安德鲁史坦顿。史坦顿勇于挑战自己，除了精采的故事内容之外，史坦顿还刻意挑战所有计算机动画师最恐惧的一件东西：水。根据《海》片的制片人之一葛翰华特斯表示：用计算机动画“表达水面之下的活动是一项艰巨任务”。因为水是透明的，水面、潮流、折射的光线以及水里物体的距离感都非常难以表达。因此以往几乎没有任何计算机动画影片敢将故事设定在水面下发生，就算是有表现水的感觉，顶多也是下雨或是几滴水花罢了。这次《海底总动员》特别挑战“水”这个元素，千万不要不信，短短的预告片当中所有的一切水面上、水面下甚至是海平面的感觉都是计算机做出来的。